Actualmente el Archivo Histórico tiene abierta una (1) colección: la de Fr. Enrique Báez, O.P.
Con la nueva reorganización que se está llevando a cabo, se deben conformar las siguientes colecciones: Biblioteca Moderna, Biblioteca Antigua, Hemeroteca, Frailes, Sermones, Parroquias, Fototeca y Videoteca, y las que se vayan desprendiendo de la organización del Fondo Acumulado.
Tomo I: Crónica de la Provincia (La Orden Dominicana en Colombia)
Tomo II: Crónica de la Provincia (La Orden Dominicana en Colombia)
Tomo III: Convento de Bogotá
Tomo IV: Convento de Tunja
Tomo V: Conventos de Chiquinquirá
Tomo VI: Conventos Cartagena
Tomo VII: Vicarías del Pacífico
Tomo VIII: Vicarías de Venezuela
Tomo IX: Misiones
Tomo X: Colegios
Tomo XI: Biografías Dominicanas
Tomo XII: Parroquias de Boyacá
Tomo XIII: Parroquias de Cundinamarca
Tomo XIV: Crónica eclesiástica y civil
Tomo XV: Parroquias de Santander
Tomo XVI: Parroquias de Santander
Tomo XVII: Vélez
Tomo XVIII: Socorro/Histórico
Tomo XIX: Vélez/Histórico
Tomo XX: Misiones
Tomo XXI: Opúsculos
Tomo XXII: Correspondencia/Baeza
Tomo XXIII: Opúsculos
Tomo XIV: Compilación de recortes